MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 plasmid pCKO3

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009793	GGAA	2	8	131	138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009793	A	6	6	158	163	100 %	0 %	0 %	0 %	157149301
3	NC_009793	TTA	2	6	185	190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149301
4	NC_009793	GCT	2	6	201	206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149301
5	NC_009793	TGGATA	2	12	230	241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149301
6	NC_009793	GGA	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149301
7	NC_009793	ATTT	2	8	350	357	25 %	75 %	0 %	0 %	157149302
8	NC_009793	T	6	6	355	360	0 %	100 %	0 %	0 %	157149302
9	NC_009793	CCA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149302
10	NC_009793	CGG	2	6	377	382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149302
11	NC_009793	TCC	2	6	392	397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149302
12	NC_009793	CTCA	2	8	493	500	25 %	25 %	0 %	50 %	157149302
13	NC_009793	ATC	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149302
14	NC_009793	ACC	2	6	551	556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149302
15	NC_009793	CA	3	6	606	611	50 %	0 %	0 %	50 %	157149302
16	NC_009793	GTTCC	2	10	631	640	0 %	40 %	20 %	40 %	157149302
17	NC_009793	TCG	2	6	680	685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149302
18	NC_009793	TCA	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149302
19	NC_009793	CAC	2	6	787	792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149302
20	NC_009793	ATG	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149302
21	NC_009793	TCC	2	6	845	850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149302
22	NC_009793	AATA	2	8	859	866	75 %	25 %	0 %	0 %	157149302
23	NC_009793	AAC	2	6	920	925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149303
24	NC_009793	TGC	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149303
25	NC_009793	TCG	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149303
26	NC_009793	ACGCC	2	10	1359	1368	20 %	0 %	20 %	60 %	157149303
27	NC_009793	GCG	2	6	1371	1376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149303
28	NC_009793	CTGAC	2	10	1391	1400	20 %	20 %	20 %	40 %	157149303
29	NC_009793	CAG	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149303
30	NC_009793	CCA	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149303
31	NC_009793	CCG	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149303
32	NC_009793	GCC	2	6	1494	1499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149303
33	NC_009793	CCG	2	6	1512	1517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149303
34	NC_009793	ATC	3	9	1638	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149304
35	NC_009793	CGC	2	6	1658	1663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
36	NC_009793	CTG	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149304
37	NC_009793	CCT	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149304
38	NC_009793	CGG	2	6	1915	1920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149304
39	NC_009793	CGC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
40	NC_009793	CAGG	2	8	1977	1984	25 %	0 %	50 %	25 %	157149304
41	NC_009793	CAG	2	6	2154	2159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
42	NC_009793	ATG	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149304
43	NC_009793	GC	3	6	2231	2236	0 %	0 %	50 %	50 %	157149304
44	NC_009793	T	6	6	2252	2257	0 %	100 %	0 %	0 %	157149304
45	NC_009793	TCG	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149304
46	NC_009793	GCC	3	9	2307	2315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
47	NC_009793	CGC	3	9	2436	2444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
48	NC_009793	CTG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149304
49	NC_009793	CGC	2	6	2496	2501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
50	NC_009793	CAG	2	6	2568	2573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
51	NC_009793	CAG	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
52	NC_009793	GCG	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149304
53	NC_009793	ACC	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149304
54	NC_009793	TGG	2	6	2759	2764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149304
55	NC_009793	TC	3	6	2969	2974	0 %	50 %	0 %	50 %	157149304
56	NC_009793	GCTG	2	8	2981	2988	0 %	25 %	50 %	25 %	157149304
57	NC_009793	CAG	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
58	NC_009793	AGC	2	6	3055	3060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
59	NC_009793	CAG	2	6	3069	3074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
60	NC_009793	CAGC	2	8	3095	3102	25 %	0 %	25 %	50 %	157149304
61	NC_009793	CCGC	2	8	3103	3110	0 %	0 %	25 %	75 %	157149304
62	NC_009793	GCA	2	6	3143	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
63	NC_009793	TAA	2	6	3151	3156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149304
64	NC_009793	C	7	7	3228	3234	0 %	0 %	0 %	100 %	157149304
65	NC_009793	TAT	2	6	3356	3361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149304
66	NC_009793	TCCG	2	8	3422	3429	0 %	25 %	25 %	50 %	157149304
67	NC_009793	CAGC	2	8	3504	3511	25 %	0 %	25 %	50 %	157149304
68	NC_009793	TC	4	8	3587	3594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009793	GGC	3	9	3665	3673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149305
70	NC_009793	GTG	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149305
71	NC_009793	CAC	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149305
72	NC_009793	GGA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149305
73	NC_009793	GGC	2	6	3794	3799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149305
74	NC_009793	AGCG	2	8	3850	3857	25 %	0 %	50 %	25 %	157149305
75	NC_009793	ACC	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149305
76	NC_009793	AGC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149305
77	NC_009793	TGC	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149305
78	NC_009793	GGT	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009793	CGGA	2	8	3989	3996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009793	GA	3	6	4011	4016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009793	CCAG	2	8	4034	4041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009793	A	6	6	4113	4118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009793	TAT	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009793	CCT	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009793	GCG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009793	CTGA	2	8	4438	4445	25 %	25 %	25 %	25 %	157149306
87	NC_009793	TCAG	2	8	4505	4512	25 %	25 %	25 %	25 %	157149306
88	NC_009793	ATC	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149306
89	NC_009793	C	6	6	4720	4725	0 %	0 %	0 %	100 %	157149306
90	NC_009793	CTG	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149306
91	NC_009793	GCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149306
92	NC_009793	ACC	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009793	GGT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009793	T	6	6	4996	5001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009793	A	7	7	5030	5036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009793	AAG	2	6	5044	5049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009793	AGG	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149307
98	NC_009793	AGA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149307
99	NC_009793	A	6	6	5172	5177	100 %	0 %	0 %	0 %	157149307
100	NC_009793	ACCTTT	2	12	5198	5209	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157149307
101	NC_009793	ATC	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009793	ACCA	2	8	5412	5419	50 %	0 %	0 %	50 %	157149308
103	NC_009793	TTA	2	6	5420	5425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149308
104	NC_009793	CAT	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149308
105	NC_009793	CAC	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149308
106	NC_009793	T	6	6	5575	5580	0 %	100 %	0 %	0 %	157149309
107	NC_009793	ACCAT	2	10	5722	5731	40 %	20 %	0 %	40 %	157149309
108	NC_009793	ACC	4	12	5743	5754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149309
109	NC_009793	AAT	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149309
110	NC_009793	T	6	6	5866	5871	0 %	100 %	0 %	0 %	157149309
111	NC_009793	ATTTA	2	10	5881	5890	40 %	60 %	0 %	0 %	157149309
112	NC_009793	T	6	6	5908	5913	0 %	100 %	0 %	0 %	157149309
113	NC_009793	ATTC	2	8	5973	5980	25 %	50 %	0 %	25 %	157149309
114	NC_009793	ATTCTG	2	12	6019	6030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157149309
115	NC_009793	ATC	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149309
116	NC_009793	TGCCTC	2	12	6118	6129	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157149309
117	NC_009793	CAG	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149309
118	NC_009793	CAGCT	2	10	6238	6247	20 %	20 %	20 %	40 %	157149309
119	NC_009793	CT	3	6	6262	6267	0 %	50 %	0 %	50 %	157149309
120	NC_009793	AGC	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149309
121	NC_009793	CTG	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149309
122	NC_009793	TCC	2	6	6323	6328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149309
123	NC_009793	CT	3	6	6395	6400	0 %	50 %	0 %	50 %	157149309
124	NC_009793	ACC	2	6	6433	6438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149309
125	NC_009793	AAT	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149309
126	NC_009793	AC	3	6	6558	6563	50 %	0 %	0 %	50 %	157149309
127	NC_009793	CCA	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149309
128	NC_009793	GGCC	2	8	6617	6624	0 %	0 %	50 %	50 %	157149309
129	NC_009793	TGC	2	6	6641	6646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149309
130	NC_009793	CAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149309
131	NC_009793	ATC	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149309
132	NC_009793	GCA	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149309
133	NC_009793	CAGC	2	8	6861	6868	25 %	0 %	25 %	50 %	157149309
134	NC_009793	GCAG	2	8	6944	6951	25 %	0 %	50 %	25 %	157149309
135	NC_009793	CCA	2	6	6986	6991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009793	ACC	2	6	7027	7032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009793	CCG	2	6	7043	7048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009793	CGT	2	6	7099	7104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009793	GCCCG	2	10	7111	7120	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_009793	ACC	3	9	7135	7143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009793	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009793	ACC	2	6	7195	7200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_009793	CGTC	2	8	7232	7239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009793	TAAAA	2	10	7286	7295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009793	TA	3	6	7320	7325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009793	A	7	7	7395	7401	100 %	0 %	0 %	0 %	157149310
147	NC_009793	CAA	2	6	7437	7442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149310
148	NC_009793	G	6	6	7541	7546	0 %	0 %	100 %	0 %	157149310
149	NC_009793	GTT	2	6	7557	7562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149310
150	NC_009793	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149310
151	NC_009793	AT	3	6	7608	7613	50 %	50 %	0 %	0 %	157149312
152	NC_009793	A	6	6	7625	7630	100 %	0 %	0 %	0 %	157149312
153	NC_009793	GCA	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149312
154	NC_009793	ACA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149311
155	NC_009793	ATG	2	6	7825	7830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149311
156	NC_009793	T	6	6	7836	7841	0 %	100 %	0 %	0 %	157149311
157	NC_009793	GCA	2	6	7902	7907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149311
158	NC_009793	CAG	2	6	7915	7920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149311
159	NC_009793	ACTC	2	8	7943	7950	25 %	25 %	0 %	50 %	157149311
160	NC_009793	CACAA	2	10	7956	7965	60 %	0 %	0 %	40 %	157149311
161	NC_009793	GCA	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149311
162	NC_009793	A	6	6	8005	8010	100 %	0 %	0 %	0 %	157149311
163	NC_009793	CGG	2	6	8131	8136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_009793	CAA	2	6	8154	8159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009793	C	7	7	8160	8166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
166	NC_009793	ATGC	2	8	8206	8213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_009793	T	6	6	8269	8274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009793	TCA	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_009793	CTGA	2	8	8297	8304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_009793	CTTC	2	8	8340	8347	0 %	50 %	0 %	50 %	157149315
171	NC_009793	AC	3	6	8391	8396	50 %	0 %	0 %	50 %	157149315
172	NC_009793	TTC	2	6	8413	8418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149315
173	NC_009793	GAA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149315
174	NC_009793	CCG	2	6	8548	8553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149315
175	NC_009793	AAC	2	6	8587	8592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149315
176	NC_009793	TGGAA	2	10	8645	8654	40 %	20 %	40 %	0 %	157149315
177	NC_009793	ACG	2	6	8677	8682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149314
178	NC_009793	ACCG	2	8	8734	8741	25 %	0 %	25 %	50 %	157149314
179	NC_009793	GCG	2	6	8752	8757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149314
180	NC_009793	ATG	2	6	8852	8857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149314
181	NC_009793	TGA	2	6	8859	8864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149314
182	NC_009793	CCAGA	2	10	8865	8874	40 %	0 %	20 %	40 %	157149314
183	NC_009793	TAA	2	6	8929	8934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149314
184	NC_009793	CCA	2	6	9011	9016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_009793	CCGG	2	8	9030	9037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
186	NC_009793	CTG	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_009793	CAG	2	6	9065	9070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_009793	CCT	2	6	9106	9111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_009793	T	6	6	9154	9159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009793	CCA	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
191	NC_009793	GCC	2	6	9257	9262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.